遗传因素
遗传因素也就是基因遗传，我们在临床上经常能发现唇腭裂婴儿中，在其直系或旁系亲属中，也有类似的畸形，这是由于某个基因的突变造成的。大约有20％左右唇腭裂患儿可查询出有遗传史。
环境因素
环境因素指的是胚胎生长发育的环境。母体是胚胎生长发育的温床，如果母体受到外界的干扰，就会影响胚胎发育，特别是孕妇在怀孕第4周到第10周期间，环境因素导致婴儿面部发育受阻。比如，孕妇在怀孕期间如果摄入的营养不足，造成维生素A、B及钙、磷、铁、叶酸等缺乏；或者孕妇妊娠时患病，特别是胚胎在第7周～第12周形成期间，服用了一些药物，如可的松、苯海拉明、朴尔敏或某些安眠药，或接受了放射性物质，如同位素等，这些因素可能会使胚胎细胞发生突变，导致发生唇腭裂。
根据研究发现，父母双方的年龄越大，他们孩子患先天性“兔唇”的风险就越高。40岁母亲与30岁母亲相比，新生儿患“兔唇”的风险要高20%.因此，为了预防新生儿“兔唇”，专家建议妊娠期妇女应注意营养摄入平衡，避免感染病毒，勿使用影响胚胎发育的药物。妊娠早期，尤其是前3个月，要避免一切不良精神刺激，避免接触放射线和外伤。有糖尿病、贫血、妇科病及甲状腺功能减退疾病的孕妇，要尽早治疗。有酗酒、吸烟习惯的妇女，必须在孕前戒烟酒，建议准备怀孕的妇女以及在怀孕的头三个月进食叶酸补充剂。要避免近亲结婚生子，大龄女性孕期要加强保健和监护。
